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实验二 目的基因与质粒DNA的酶切与连接
1 实验目的
学习使用限制型内切酶进行DNA酶切和T4连接酶进行连接的原理和方法。
2 实验原理
迄今已发现了3000多种限制性内切酶。传统上将限制性内切酶按照亚基组成、酶切位置、识别位点、辅助因子等因素划分为三大类。II型酶在其识别位点之中或临近的确定位点特异地切开DNA链。它们产生确定的限制片段,因此是三类限制性内切酶中唯一用于DNA分析和克隆的一类。
II型限制性内切酶中最普遍的是象EcoR I、Hind III、BamHI和Not I这样在识别序列中进行切割的酶。这一类酶是构成商业化酶的主要部分。大部分这类酶都以同二聚体的形式结合到DNA上,因而识别的是对称序列;但有极少的酶作为单聚体结合到DNA上,识别非对称序列。一些酶识别连续的序列(如EcoR I识别GAATTC;Hind III识别AAGCTT;BamHI识别G↓GATCC; Not I识别GC↓GGCCGC);而另一些识别不连续的序列(如Bgl I识别GCCNNNNNGGC)。限制性内切酶酶切DNA后形成两种类型的末端:(i)两条链断裂的位置是交错地,产生粘性末端,如EcoR I酶切后产生末端;(ii)两条链的断裂位置处在一个对称结构的中心,产生平末端,如HaeIII酶切后产生
5’-G↓AATTC
5’-G↓AATTC
3’-CTTAA↓G
5’-GG↓CC
3’-CC↓GG-5
DNA连接酶能够催化在两条DNA链之间形成磷酸二酯键,这种酶需要在一条DNA链的3’-末端具有一个游离的羟基(-OH),和在另一条DNA链的5’-末端具有一个磷酸基团(
3 实验材料、仪器及试剂
3.1 实验材料与试剂
限制性酶 BamHⅠ和 Hind Ⅲ、 T4DNA连接酶及其缓冲液、 DNA琼脂糖电泳所用试剂、10×loading buffer、核酸染料GoldView、 DNA胶回收试剂盒、小指管、吸头等
3.2 仪器准备
恒温水浴锅、台式离心机、凝胶成象仪、Dark Reader荧光投射仪、旋涡混合器、电泳仪、电泳槽
4 操作步骤
4.1 酶切
(1)酶切目的基因
按如下体系混合:
反应物(μL)
EGFP片段
pET-28a
AKP DNA
24
24
BamH I
2
2
Hind III
1
1
10×buffer K
3
3
离心10s,混匀。37℃水浴酶切3h。
(2)酶切载体
按如下体系混合:
反应物(μL)
EGFP片段
pET-28a
pETBlue-2
10
10
BamH I
2
2
Hind III
1
1
10×buffer K
2
2
dd水
5
5
离心10s,混匀。37℃水浴酶切3h。
4.2 酶切产物进行琼脂糖电泳,用DNA回收试剂盒进行回收酶切产物。
4.3 检测酶切后的目的基因和质粒的浓度
4.3 连接
测定载体和目的基因的DNA浓度之后,按照连接体系进行,16℃连接过夜。
反应物
体积/μL
酶切后载体
1.5
酶切后目的基因
13.5
T4连接酶
2
缓冲液(10×)
2
dd水
1
5.实验结果与分析及感想
从图片上可看到白色条带是DNA样品所在位置 左侧泳道是DNA Marker 右侧4个泳道是DNA样品 ,其中1,2是酶切后的AKP基因,是1500bp左右,3,4是酶切后的质粒。将这四个条带进行回收并连接,导入感受态细胞转化。重组DNA 的成功构建是AKP基因克隆表达的关键所在。
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