上海海洋大学《分子生态学》课件-15分子生态学+量化种群的分化 .pdf

第二节量化种群的分化

一、遗传距离

衡量两个种群的遗传相似性的方法之一是估计种群间的遗传距离，

最常用的方法是Nei（1972）标准遗传距离Q。计算Q值，首先需要了解

遗传同一性衡量指标（/）,该指标反映了种群间的遗传相似性。对于

任意位点，遗传同一性可以表示为：

m

,苕（P*）

/一mm

以（P2Q（菖（P2Q]O.5

其中，珏是等位基因灌种群乂中的频，P是等位基因，在种群y中的

频，m是该等位基因数目。I的取值范围从0到1。

第二节量化种群的分化

一、遗传距离

根据/值，按照下列公式即可计算遗传距离

Z=-lnZ

如果两个种群有相似的等位基因频，即心广今，则两个种群的遗

传相似性/将趋近于1,而遗传距离。将趋近于0；如果两个种群没有任何

共有的等位基因，则，为0,D趋近于无穷大。

二、F・统计量

量化种群间遗传分化最常用的方法是F.统计量Wright(1951),该

指标用近交系数来描述遗传变异在种群内和种群间的分配。F•统计量可

以在三个不同的水平进行计算，包括种群内、种群间和整个种群近交的

数量。描述这些水平时，习惯上把空间分离的样本称为亚种群。

第二节量化种群的分化

二、F・统计量

1%

灼s衡量个体内相对于亚种群的其余部分的近交程度，反映了同一个

体内两个等位基因同源一致的概，与前章介绍的近交系数F计算相同,

其计算公式为：

F一氏电

其中，％是调查时亚种群的观测杂合度（个体杂合度），为是亚种

群在HW情况下的预期杂合度（亚种群杂合度）o

第二节量化种群的分化

二、F・统计量

2.Fst

也称为固定系数，可对亚种群的遗传分化进行估计。该指标衡量

的是相对整个种群（这里的种群指所有的亚种群）而言，亚种群内的近

交（基因漂变）程度，反映了亚种群内随机抽取的两个等位基因同源一

致的概，其计算公式为：

其中，％是亚种群在HW情况下的预期杂合度，而是整个种群

（即相关的亚种群整合起来）的预期杂合度。如果两个种群具有相同的

等位基因频，它们没有遗传分化，则Fst为0,如果两个种群固定了不

同的等位基因，则Fst等于1。

第二节量化种群的分化

二、F・统计量

2.Fit

灼,衡量个体相对于整个种群的杂合度，计算个体的总近交系数，该

指标既受到亚种群内非随机交配（近郊系数A’）的影响，也受到种群分

化（Fst）的影响：

其中，是整个种群（即相关的亚种群整合起来）的预期杂合度,

而％是调查时亚种群的观测杂合度。

这三个统计量之间的关系为：

Fit二F[s+FstYF[s)(Fst)

第二节量化种群的分化

二、F・统计量

利用猩红虎蛾的两个亚种群的虚拟数据来计算凡统计量:

要计算压统计量，先要计算反1、久和t值。