分子生物学本基因组及基因组学概论详解演示文稿.ppt

分子生物学本基因组及基因组学概论详解演示文稿 本文档共33页；当前第1页；编辑于星期三\2点0分 优选分子生物学本基因组及基因组学概论 本文档共33页；当前第2页；编辑于星期三\2点0分 一、基因组与基因组学概论 1. 基因组的概念 一种生物或一种遗传系统的所有基因 （遗传物质）的组合 染色体组（chromosome set） 基因组（genome） 本文档共33页；当前第3页；编辑于星期三\2点0分 2. 基因组的种类与结构特点 （1）种类 类核基因组（nucleoid genome） 即原核基因组（prokaryotic genome） 核基因组（nuclear genome） 即真核基因组（eukaryotic genome） 细胞器基因组（organelle genome） 线粒体基因组（mitochondrial genome） 叶绿体基因组（chloroplast genome） 本文档共33页；当前第4页；编辑于星期三\2点0分 2. 基因组的种类与结构特点 其他 病毒基因组（virus genome） 质粒DNA（plasmid DNA），又称染色体 外DNA（extrachromosomal DNA） 本文档共33页；当前第5页；编辑于星期三\2点0分 2. 基因组的种类与结构特点 （2）大小 基因组大小（genome size）一般以单倍体基因组的核酸量来衡量，单位有pg（10-12 g）、Dalton（道尔顿）、bp 或 kb 、Mb等 1 pg = 6.02 x 1011 Daltons = 9.8 x 108 bp 本文档共33页；当前第6页；编辑于星期三\2点0分 生物的复杂程度与基因组大小的关系 本文档共33页；当前第7页；编辑于星期三\2点0分 生物的基因组大小及其变化 原核生物的genome size一般都比较小，且变化范围也不大（最大/最小约为20）。细菌基因组一般可含500 ~ 8000个基因。由于原核生物基因组中的非基因DNA（non-genic DNA）的含量较少，因此它们的基因组大小与其所含的基因数目是相对应的 真核生物的genome size一般要比原核生物的大很多，且变化范围也很大（最大/最小可达8万） 本文档共33页；当前第8页；编辑于星期三\2点0分 真核生物C值佯谬（C值反常现象）（C-value paradox） C值：基因组的大小通常以一个基因组中的DNA含量来表示，称为生物体的C值。 C值矛盾：C值和它进化复杂性之间并没有严格的对应关系 本文档共33页；当前第9页；编辑于星期三\2点0分 本文档共33页；当前第10页；编辑于星期三\2点0分 本文档共33页；当前第11页；编辑于星期三\2点0分 2. 基因组的种类与结构特点 （3）类核基因组和核基因组的结构特点 类核基因组 环状，较小；通常由单拷贝或低拷贝（low-copy）的DNA序列组成；基因排列紧密，较少非编码序列 核基因组 多线状；大小一般要比类核基因组大好几个数量级，且变化范围很大；有大量的非编码序列（重复序列、内含子等） 本文档共33页；当前第12页；编辑于星期三\2点0分 2. 基因组的种类与结构特点 （4）细胞器基因组 线粒体基因组 在不同类型的生物（多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌）中变化很大 多细胞动物：细小、致密，没有或很少非编码序列 高等植物：复杂、不均一，比动物的大得多 原生动物、藻类、真菌：或偏向于动物型，或偏向于植物型，但又有其各自的独特之处 本文档共33页；当前第13页；编辑于星期三\2点0分 本文档共33页；当前第14页；编辑于星期三\2点0分 本文档共33页；当前第15页；编辑于星期三\2点0分 2. 基因组的种类与结构特点 （5）细胞器基因组 叶绿体基因组 比较均一，85 ~ 292 kb（大部分都在120 ~ 160 kb之内）； 特例：伞藻属（Acetabularia），2000 kb 本文档共33页；当前第16页；编辑于星期三\2点0分 Acetabularia 本文档共33页；当前第17页；编辑于星期三\2点0分 本文档共33页；当前第18页；编辑于星期三\2点0分 IR: Inverted Repeat SSC: Small Single Copy region LSC: Large Single Copy region 本文档共33页；当前第19页；编辑于星期三\2点0分 3.