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生化—蛋白质的课件资料;1.1 氨基酸
1.2 肽
1.3 蛋白质的分子结构
1.4 蛋白质结构和功能的关系
1.5 蛋白质的重要性质
1.6 蛋白质的分类
1.7 蛋白质的分离与鉴定;1.3 蛋白质的分子结构?;一级结构(p41) : 氨基酸序列和二硫键的位置
二级结构(p57):主链规律的空间排列
(α-螺旋, β-折叠)
超二级结构
结构域(domain)
三级结构(p70):所有原子空间位置
四级结构(p83):多肽链间的相互关系
维持蛋白质空间结构稳定的因素;三、蛋白质的超二级结构和结构域;??:由两股平行或反平行排列的右手螺旋段相互缠绕而成的左手卷曲螺旋。——Keratin(角蛋白p65), myosin(肌球蛋白)
???:由两段平行?折叠股和一段作为连接链的?螺旋组成,?股之间还有氢键相连。——拥有β-sheet的蛋白质
??:由一条多肽链的若干段?折叠股反向平行组合而成,两个?股间通过一个短环连接起来。——拥有β-sheet的蛋白质;??;细胞色素C的αα结构;细胞核抗原的βαβ结构;纤溶酶原的ββ结构 ;第11页/共62页;β折叠在蛋白质中的不同形式;βαβ在蛋白质中(Rossmann folding);第14页/共62页;第15页/共62页;第16页/共62页;第17页/共62页;2、结构域(domain,p72);例如;(3) 意义;肌钙蛋白C的结构域
Structural domains in the polypeptide troponin C.
This calcium-binding protein associated with muscle has separate calcium-binding domains, indicated in blue and purple.;;木瓜蛋白酶;四、球状蛋白质的三级结构 p70(tertiary structure);β-折叠;细胞色素C; 抹香鲸肌红蛋白的立体结构表示法(三级)
;?由124个氨基酸残基组成
?多肽链折叠形成3个?-螺旋、6个?-折叠片以及一些?-转角和无规则卷曲
?二级结构再组合形成近似卵圆的结构
?表面有一个凹陷,构成酶活性中心的3个氨基酸残基就集中于此;肌红蛋白;血红素(Heme)是铁卟啉化合物,由4个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键,其中4个与吡咯环的N配位结合,1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合,氧则与Fe2+ 形成第6个配位键,接近第64位(E7)组氨酸。;血红素(Heme)是铁卟啉化合物,由4个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+居于环中。铁离???有6个配位键,其中4个与吡咯环的N配位结合,1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合,氧则与Fe2+ 形成第6个配位键,接近第64位(E7)组氨酸。;核糖核酸酶A三级结构示意图;抹香鲸肌红蛋白(Myoglobin)的三级结构;五、蛋白质的四级结构 p83 (quaternary structure); Some proteins contain two or more separate polypeptide chains, or subunits, which may be identical or different. The arrangement of these protein subunits in three-dimensional complexes constitutes quaternary structure.;去氧血红蛋白; 原体(protomer):对称的寡聚蛋白质分子可视为由两个或多个相同结构成分组成,这种相同结构成分称为原聚体或原体。
例如:血红蛋白
(?2?2)的原体是??。;蛋白质的旋转对称
Rotational symmetry in proteins;蛋白质的旋转对称
Rotational symmetry in proteins;蛋白质的旋转对称
Rotational symmetry in proteins;实例:;O2 transport;血红蛋白四级结构;烟草花叶病毒(TMV);烟草花叶病毒外壳蛋白(亚基);微原纤维(4个右手卷曲的螺旋对);六、蛋白质空间结构稳定的因素 p73;构型与构象; 定义:是一种由弱酸性的供体基团(D-H)和一个具独对电子的原子(A)之间形成的最显著的静电作用力。(p75)
在生物系统中,D和A两者都是高电负性的N和O以及S原子。 ;生物体系中常见氢键
氢受体通常是氧或氮;
氢
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