09CRISPRi技术及CRISPRa技术论文文献分享.pdf

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CRISPRi,CRISPRaCRISPRscreeningandsgRNA

library

◼dCas9的特征简介

◼运用CRISPR技术调控基因在细胞中表达的基本实验过程

◼CRISPR技术介导的转录抑制(CRISPRi)

◼CRISPR技术介导的转录活化(CRISPRa)

◼CRISPRscreen

dCas9的特征简介

◼RuvC和HNH结构域是Cas9蛋白负责切割

DNA的结构域

◼D10A和H840A突变分别会导致RuvC和

HNH结构域失去活性从而形成无DNA切割活

性的Cas9蛋白,即dCas9(deadCas9)

运用CRISPR技术调控基因在细胞中表达的基本实验过程

CRISPR技术介导的转录抑制(CRISPRi)

BFP蓝色荧光蛋白

KRABKruppel-associatedbox一种转录抑制因子

在GFP基因的启动子和编码区的8个位点设计gRNA,检测dCas9-KRAB+gRNA对

GFP表达的抑制作用。最高达15倍的抑制效果。C为瞬时转染,D为稳定转染

CRISPR技术介导的转录活化(CRISPRa)

将dCas9与转录激活因子VP64或者p65AD融合。在由mCMV启动子启动的GFP基因上游添加4个

Gal4基因的上游转录激活序列,其中有3个可被sgGAL4-1所识别的序列。dCas9-VP64、dCas9-

p65AD与gRNA共转染后,荧光强度分别提高25倍和12倍

◼FusionofdCas9toeffectordomainswithdistinctregulatoryfunctions

enablesstableandefficienttranscriptionalrepressionoractivationin

humanandyeastcells,withthesiteofdeliverydeterminedsolelybya

coexpressedshortguide(sg)RNA.

◼CRISPRinterference(CRISPRi)-mediatedtranscriptionalrepressionis

highlyspecific

◼可以和Cas9融合的抑制因子:

◼https:///crispr/interfere/

◼可以和Cas9融合的激活因子:

◼https:///crispr/activate/

CRISPRscreening

◼Knockouteverygene,butknock

outonlyonegenepercell

◼Getcellswithadifferentgene

knockedoutineachcell.Some

cellswilldie,butotherswill

survive.

◼NGSisperformedontheentire

mixedcellstodeterminewhich

sequencesarepresentandwhich

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