DNA的提取与电泳.ppt

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血液DNA的提取与电泳1.取洁净EP管1只,加入200μL抗凝血。2.加入20μL蛋白酶K溶液,混匀。3.加入200μL缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10min,溶液应变清亮。简短离心以去除管壁内的水珠。4.加入200μL无水乙醇,充分振荡混匀15sec。此时可能会出现絮状沉淀。简短离心以去除管壁内的水珠。5.将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12000rpm(13400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。6.向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD(使用前请检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。7.向吸附柱CB3中加入700μL漂洗液PW(使用前请检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。8.向吸附柱CB3中加入500μL漂洗液PW,12000rpm离心30sec,倒掉废液。9.将吸附柱CB3放回收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液。10.将吸附柱CB3于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残留的漂洗液。11.吸附柱CB3转入一个干净的EP管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μL洗脱缓冲液TE,室温放置2-5min,12000rpm离心2min,将溶液收集到EP管中,保存在4℃冰箱。注意事项(一)1.最好使用新鲜材料,低温保存的样品材料不要反复冻融。2.材料应适量,过多会影响裂解,导致DNA量少,纯度低。3.DNA沉淀用乙醇或异丙醇都可以。异丙醇沉淀的效率要高于无水乙醇,试验中只需要0.6倍体积的异丙醇沉淀;而需要2倍体积的无水乙醇。但是异丙醇沉淀容易将盐成分一起沉淀,且在DNA沉淀中异丙醇难以挥发除去。4.若长期储存建议使用TE缓冲液溶解。注意事项(一)5.此试剂盒可用于提取哺乳动物全血,当提取量为100-400μL时,DNA得量为3-10μg。6.此试剂盒可直接用200μL新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,不足200μL可加缓冲液GA补足。7.如需处理更大体积血液,如300μL-1mL,应按以下步骤操作:在样品中加入3倍体积红细胞裂解液,颠倒混匀,室温放置5min,期间再颠倒混匀几次。10000rpm离心1min(或3000rpm离心5min),吸去上清,留下白细胞沉淀,加200μL缓冲液GA,振荡至彻底混匀。注意事项(一)8.在260nm的读数用于计算样品中的DNA浓度,OD值为1相当于大约50μg/mL的双链DNA,40μg/mL的单链DNA或RNA。C(μg/mL)=OD260×509.可根据在260nm以及在280nm的读数间的比值(OD260/OD280)估计DNA的纯度。1.8左右为好,低于此值表明有蛋白质或酚污染,高于此值表明有RNA污染。10.紫外分光光度法可检测浓度为1-50μg/mL的DNA样品。操作步骤:1.根据所需浓度(0.5%)称取0.5g的琼脂糖,加人100mLTBE(0.5×)溶液。2.微波炉加热1min进行化胶。3.对电泳槽的缝隙进行封胶。4.当冷却至60℃左右时,加入溴化乙锭5μL,然后灌胶,胶的厚度约在5~7mm(倒胶时注意沿一角缓慢倒入,防止气泡产生)。5.将梳子插入凝胶,制作点样孔。6.待凝胶凝固后(30-45min),将梳子垂直拔出。操作步骤:7.将凝胶板放入电泳槽,倒入电泳缓冲液,以超过凝胶1mm左右为准。8.在10μLDNA样品中加人1/5的上样缓冲液并混匀。9.用微量移液枪将DNA样品小心加入样品槽中。10.合上电泳槽盖,接通电源。控制电压保持在100V。11.当溴酚蓝条带移动到距凝胶前沿约1cm时,停止电泳。12.放入紫外光透射仪观察并拍照。注意事项(二)1.可以在凝胶和电泳缓冲液中加入溴化乙锭,浓度为0.5μg/mL。2.溴化乙锭有潜在的致癌性,操作时要带上手套。3.在1-5V/cm凝胶的电压降下进行电泳。(按两极间距离计算)4.少至1-10ng的DNA条带即可在紫外灯下检出。5.如加入过多的DNA,加样孔超载,会导致拖尾和弥散。哺乳动物DNA限制酶消化产物,每孔可加入20-30μgDNA而不致明显影响分辨力。注意事项(二)6.一些限制酶(如BamHⅠ或EcoRⅠ)缓冲液中的高浓度盐会拖慢DNA的迁移率并使邻孔内DNA的电泳出现畸变。7.溴酚蓝在琼脂糖凝胶中的泳动速度约为二甲苯

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