微生物第5章分类与鉴定.ppt

关于微生物第5章分类与鉴定一、生物的系统发育和进化1、对生物分类的两种原则：传统：根据表形特征的相似程度分类。重在应用，不以反应生物之间的进化关系为目的现代：通过比较不同物种间基因序列的相关性来类，目的是探寻各物种间的进化关系，建立反映生物发育相关性的分类系统。第2页,共25页，2024年2月25日，星期天2、传统的分类体系1753年：瑞典人林奈（CarrolusLinneaus）两界分类系统：生物动物植物1969年：惠特克（R.H.Whittaker）：原核生物界：细菌、蓝细菌原生生物界：原生动物、单细胞藻类五界系统真菌界：真菌、酵母菌植物界动物界第3页,共25页，2024年2月25日，星期天3、反映生物系统发育相关性的进化计时器生物AA、B间的生物B进化关系理想的生物进化计时器应具备的条件：见书原核生物核糖体（70S）：大亚基（50S）：蛋白质+23SrRNA+5SrRNA小亚基（30S）：蛋白质+16SrRNA真核生物核糖体（80S）：大亚基（60S）：蛋白质+28SrRNA+5~5.8SrRNA小亚基（40S）：蛋白质+18SrRNA比较两者核苷酸or氨基酸序列差异（进化计时器）第4页,共25页，2024年2月25日，星期天20世纪70年代，沃斯（CarlWoese）根据生物核糖体中18SrRNA和16SrRNA的碱基序列将生物划分为3个“域（domain)“或称“原界”：古细菌原界（Archaea）：甲烷菌，嗜盐菌，嗜热菌等真细菌原界（Bacteria）：除古细菌外的其它原核生物真核生物原界(Eukarya)：原生生物、真菌、动物、植物4、三域分类学说第5页,共25页，2024年2月25日，星期天生物的三原界系统发育树第6页,共25页，2024年2月25日，星期天二、微生物的分类单元和命名：

1、种以上的微生物分类单元：界（Kingdom）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）、种（Species）2、对于微生物来说，种的概念：表型特征和包括16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群，而且这个菌株群和其它类群有明显差异。3、种以下的分类概念：菌株（strain）、模式菌株（typestrain）亚种（subspecies）型（form）：生物型、血清型、噬菌体型……第7页,共25页，2024年2月25日，星期天4．菌种学名（1）按《国际细菌命名法规》命名的，国际公认，通用的正式菌种名字。采用林奈的双名法：学名：属名+种名加词（字母均为斜体）属名：拉丁文或希腊文，名词，单数，第一个字母大写，描述微生物的一般的、主要的特性。种名加词：拉丁文或希腊文，形容词，字母小写，描述该菌种具体、次要特征。例：金黄色葡萄球菌：Staphylococcusaurous结核分枝杆菌：Mycobacteriumtuberculosis第8页,共25页，2024年2月25日，星期天如果泛指某一属的微生物，或某菌种，知其属但种名未定，可用“sp”“spp”作加词：Bacillussp:一个尚未定名的芽孢杆菌Bacillusspp:泛指芽孢杆菌属的菌种（2）种以下分类：亚种（subspecies,subsp）指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，例：蜡状芽孢杆菌的蕈状亚种：Bacillu