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对于性染色体上基因的基因频率计算：
一般情况下，Y染色体上不存在对应的等位基因，因此计算方法与上面不同，计算时遵循以下规律：
以人类的色盲遗传病为例，解释上表：
女性的性染色体组成是XX，男性的性染色体组成是XY，对于色盲基因，Y染色体上没有对应的等位基因，因此在男性群体中，XB和Xb的基因频率与基因型频率相同，设XB的基因频率为p，Xb的基因频率为q，则XB的基因频率=XBY的基因型频率=p，Xb的基因频率=XbY的基因型频率=q，且p+q=1；
由于男性细胞中的XB、Xb均来自于女性，也就是说女性群体能够产生XB和Xb两种基因型的配子，且基因型为XB的配子所占的比例是p，基因型为Xb的配子所占的比例为q，故在女性群体中，XB的基因频率为p，Xb的基因频率为q，p+q=1；因此对于女性群体来说，位于X染色体上的等位基因所遵循的关系为p2(XBXB)+2pq(XBXb)+q2(XbXb)=1；
由于男性和女性的XB基因频率相同，二者的Xb基因频率也相同，那么在整个人群中，XB、Xb的基因频率也分别为p、q；整个人群中男性产生的配子及比例为1/2pXB、1/2qXb、1/2Y，女性产生的配子及比例为pXB、qXb，因此：
综上所述，就会得出表中的数据，以及雄性中XB基因频率=雌性中XB基因频率=整个群体中XB基因频率=p；雄性中Xb基因频率=雌性中Xb基因频率=整个群体中Xb基因频率=q；
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