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高分meta分析的选题、写作与投稿
第一章 高分 meta 的第一要素:
找对选题
孙敏 谷万杰
PART 05
meta 老手也常犯的选题误区
低分逃不掉,如何破瓶颈
︳选题导向的困惑和误区 CONTENT 02 ︳ 数据优先的困惑和误区
03 ︳ 高大全的困惑和误区
选题导向的困惑和误区
兴趣导向
临床导向 Meta分析 热点导向
数据导向
年轻学者的选题困惑:科研随兴趣,还是跟热点
?
疑问的根源
兴趣导向
1.
疑问的根源:学术评价都是以论文的
影响因子(有的说点数,有的说分
数,都是指期刊的IF值)为主要指
临床导向
热点导向
标,甚至是唯一指标
Meta分析
2.
IF决定命运:学术论文的IF值高,晋
升、评奖、申请课题、各种人才计
划,甚至研究生的国奖评审和工作应
聘等,都会很顺利。IF低,举步维艰
数据导向
3.
IF>5:国家自然科学基金申请要求
IF>5分的文章
年轻学者的选题困惑:科研随兴趣,还是跟热点
兴趣导向
?
热点 vs 兴趣
1.
经典和时尚:不同的领域学术期刊的
IF是不同的,学术研究也有传统和时
临床导向
热点导向
尚之别
Meta分析
热点IF高:时髦的热点领域,从事研
2.
究的人多,引用率也就高,传统经典
的学科,情况就相反
数据导向
3.
喜欢即幸运:从学术追求上,理应随
自己的内心,追求自己的学术兴趣
年轻学者的选题困惑:科研随兴趣,还是跟热点
兴趣导向
?
理想 vs 现实
1.
理想是丰满的,现实是残酷的
临床导向
热点导向
2.
年轻学者首先要在学术界站住脚,立稳脚跟
Meta分析
3.
研究生也要顺利毕业,需要找到一个好工作
4.
有时候还需要面对现实,需要追求热点、追
数据导向
击关键点
5.
仰望星空,脚踏实地
终极导向:自己兴趣+当前热点
我的例子:肠癌芯片meta流程图
确定研究对象 结直肠癌(tumor vs normal) 正常组织vs腺瘤 结直肠癌vs淋巴转移 结直肠癌vs肝转移
数据收集整理
GCBI(tumor vs normal)GEOArrayExpress TCGA
排除
可能合格的芯片
制定纳入及排除标准
矩阵数据应用per或者DAVID进行注释
阅读分组信息和注释信息 分组是否正确,纳入合适的分组(3组->2组)
芯片数据应用arraytools进行注释
排除 信息不全 合格者纳入 样本量(>30),芯片类型(agilent, affymetrix 平台)
Meta分析找到差异基因
排除 病毒、
统一miRNA命名
无名miRNA
WGCNA网络分析
功能富集
诊断分析
预后分析
分期差异
亚型
转移差异
趋势分析
差异分析
Tumor vs normal
淋巴结转移
肝转移
分期
终极导向:自己兴趣+当前热点
普通meta收集数据具体步骤
建立数据库
芯片meta收集数据具体步骤
1.
文献的基本信息
1.
GSE和ArrayExpress编号
2.
芯片的类型和方法学特征
2.
芯片的类型和分组特征
3.
研究对象特征
3.
样本特征和基因表达值
干预措施和结局测量指标(临床数据) 4. 临床数据:诊断、预后、分期差异模型
5. 结果测量: 主要结局、次要结局 5. 结果可视化:GO富集分析、KEGG功能、
共表达网络、趋势分析,亚型分析,
预后分析、诊断模型(临床结局)
终极导向:自己兴趣+当前热点
Hub miRNA森林图 体内、体外实验验证
组织样本、细胞
miRNA & 靶基因
靶基因及rescue
周期、凋亡、侵袭、转移、增殖、克隆、划痕
靶基因 表达、免疫组化、免疫荧光定位
meta 老手也会遇到的新问题:数据导向,还是临床导向
兴趣导向
临床导向 Meta分析 热点导向
数据导向
--感谢谷万杰老师指点
单纯数据导向形成的误区
only合并:单纯合并,没有其他
回头看:先看数据结果,回头看能得出什么结论
做的比较浅:单纯利用数据,数据挖掘不充分
没有亮点:没有找到好的突破点让人眼前一亮
脱离临床:不能从临床角度解读挖掘数据
没有方向感:不懂得如何解读数据、挖掘数据
meta 老手也会遇到的新问题:数据导向,还是临床导向
兴趣导向
临床导向 Meta分析 热点导向
数据导向
--感谢谷万杰老师指点
单纯临床导向形成的误区
只看到问题:满眼都是问题,无法剥离出来
盲目自信,相信经验:收集数据、挖掘数据不重要
临床问题太大:单纯meta分析的数据无法回
答
陷入临床:无法收集和分析数据
找不到突破点切入口:从复杂的问题中找到自己能解决的问题(支点),撬动所有问题
不灵活:不会改变临床角度,科学寻找数据
meta 老手也会遇到的新问题:数据导向,
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