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南京农业大学学报2023,46(5):852861http://nauxb.njau.edu.cn
JournalofNanjingAgriculturalUniversityDOI:10.7685/jnau.202208004
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陈雪琴,庞倩倩,裴丹,等.葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选[J].南京农业大学学报,2023,46(5):852861.
CHENXueqin,PANGQianqian,PEIDan,etal.IdentificationofgrapeVvGCN5geneandscreeningofinteractingproteins[J].JournalofNanjing
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AgriculturalUniversity,2023,46(5):852861.
葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选
陈雪琴,庞倩倩,裴丹,任艳华,房经贵∗
(南京农业大学园艺学院,江苏南京210095)
摘要:[目的]本文旨在揭示组蛋白乙酰转移酶GCN5(generalcontrolnon⁃repressible5)在葡萄生长发育过程中的调控机制,
并筛选出与VvGCN5互作的蛋白,以期为进一步构建VvGCN5在葡萄生长发育中的调控网络提供理论基础。[方法]利用
生物信息学技术对VvGCN5的蛋白二级结构、基因结构、功能域、启动子的顺式作用元件以及抗逆的表达量和时空表达进
行分析,并在烟草中进行亚细胞定位,研究VvGCN5表达位置。通过酵母双杂交技术筛选与VvGCN5互作的蛋白,并通过
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双分子荧光互补(BIFC)技术进行验证。[结果]VvGCN5的二级结构由α螺旋、延伸链、β折叠以及无规则卷曲构成,含有
10段内含子序列和11段CDS序列,具有Acetyltransf_1和Bromodomain结构域,以及ARE、GT1⁃motif、TGACG⁃motif、CAT⁃
box、CGTCA⁃motif等顺式作用元件。通过查询GEO数据库发现VvGCN5可能受到光照和灰霉病的影响。VvGCN5主要表
达于葡萄的成熟茎、萌芽初期、心皮、种子中。亚细胞定位发现VvGCN5位于细胞核和细胞膜上。此外,以pGBKT7⁃VvGCN5
作为诱饵蛋白,通过酵母双杂交技术和双分子荧光互补技术发现8个阳性蛋白与VvGCN5互作。[结论]本研究鉴定并分
析了VvGCN5的基本信息,并得到了8个与VvGCN5互作的蛋白。
关键词:葡萄;VvGCN5;酵母双杂交技术;双分子荧光互补;生物信息学分析
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中图分类号:Q943.2;S512.1文献标志码:A文章编号:10002030(2023)05085210
IdentificationofgrapeVvGCN5geneand
screeningofinte
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