开展临床数据服务的实践与认识.pptx

开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第1页。 开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第2页。 2017年正式成立大数据中心，主要职能：开发利用医疗数据资源，为全院科技创新提供服务人员构成信息技术、数据分析、生物信息、生物医学工程开展的数据服务3年来，服务约200个数据研究项目来自于全院的数据服务申请，临床为主覆盖各种类别的数据分析类型开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第3页。 数据服务类型分布专病库建设项目最多预测及辅助诊断类有较 高占比0510152025303540相关因素分析 对照性分析 描述性统计卫生经济学评价其它 中断生物组学数据处理分析辅助诊断疾病及不良事件预测数据提供专病库建设数据服务项目分类统计开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第4页。 数据使用情况分布以住院数据为最多病历文本数据较少多模态数据有一定比例0102030405060多模态数据其他类型信息病理图片体检信息急诊相关信息门诊信息电子病历信息医学影像生物组学数据住院信息使用数据类型统计包括：门诊+住院信息 住院+随访信息开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第5页。 项目来源分布来自于临床需求的自研项目最多院内大数据课题其次自研项目54%本院课题28%国家课题11%其它7%项目来源统计开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第6页。 研究项目申请者的类别分布临床医生为主体研究生课题有较高占比：26%博士研究生：16.8%硕士研究生：9.5%护理、药学、医技人员占比较低医生59%研究人员4%研究生26%其他11%研究人员类别统计开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第7页。 10%30%10%数 据 提 取数 据 清 洗描 述 统 计 分 析15%20%数 据 预 处 理建 模 分 析效 果 评 估模 型 解 释5%10%工 作 量 占 比开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第8页。 开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第9页。 临床数据研究应以临床问题为导向选择临床实践中的难点或存在困惑的问题通过数据分析发现人工不易察觉或掌握的规律实践中的问题相当一部分项目为建立专病数据库，对于研究问题不明确或不具体一些项目拟开展的研究价值不高例一：建立乳腺专病库，开展年龄分布等描述性统计，其规律皆已知例二：对糖尿病患者诊断为糖尿病肾病进行判断，由于有明确的诊断标准，研究 价值不高开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第10页。 样本设计问题—肿瘤与过敏性皮炎两种免疫相关疾病之间的关联研究方案一，病例对照：肿瘤患者中曾患皮肤过敏病例与健康人群的皮肤过敏病例 需要获取住院肿瘤患者的既往皮肤过敏情况，但病历记录不可靠方案二，回顾性队列：皮肤过敏患者中后期患肿瘤疾病的病例 由于患者人群的不稳定，持续观察难以实现正确的方案应是固定人群的队列研究病例数据能够支持的研究有限研究方案要考虑医院病例样本的局限性本院 皮肤 过敏 患者本院 肿瘤 患者患者 外流开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第11页。 针对临床提出的研究问题，需要可行性预研究，包括：数据内容是否覆盖研究需要样本数量是否充足实践中的问题一些项目在数据抽取、清洗上花较长时间，但由于可行性问题导致研究中止例一：超声引导下的甲状腺消融术后疗效研究，需患者门诊随访，术后一年内随 访效果较好，术后超过一年随访人数急剧下降例二：腰椎融合术前注射封闭对术后感染的影响研究，通过一系列排除条件对人 群进行删减后，符合条件的正样本（术前打封闭的人）过少开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第12页。 由于样本自身分布的偏倚，导 致数据分析结论偏差例：帕金森患者发病与出生月 份相关性研究对于相关性结论需要从样本分 布的角度进行推敲0500100015002000帕金森患者出生月份分布1000000800000600000400000200000001 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 1201 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12普通人群出生月份分布开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第13页。 数据处理是人工与自动化工具相结合的过程，需要的处理工具包括：数据筛选、结构化特征提取、数据转换、缺失值插补等对处理工具的灵活性和场景适用性要求高现有工具的适用性不足，以结构化特征提取为例：一些结构化特征需要针对研究问题以“量体裁衣”方式提取由于样本数量多在千例甚至数百例，而基于机器学习的结构化方法需要大量标注， 工作量得不偿失例：前列腺癌研究中，磁共振报告结构化特征提取开展临床数据服务的实践与认识全文共24页，当前为第14页。 前列腺磁共振检查报告结构