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常用酶切位点表(含保护碱基)
酶
寡核苷酸序列
切割率%
2 hr
20 hr
Acc I
GGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG
0 0 0
0 0 0
Afl III
CACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG
0 >90 >90
0 >90 >90
Asc I
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
>90 >90 >90
>90 >90 >90
Ava I
CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA
50 >90 >90
>90 >90 >90
BamH I
CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG
10 >90 >90
25 >90 >90
Bgl II
CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC
0 75 25
0 >90 >90
BssH II
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
0 0 50
0 0 >90
BstE II
GGGT(A/T)ACCC
0
10
BstX I
AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
0 25 25
0 50 >90
Cla I
CATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG
0 0 >90 50
0 0 >90 50
EcoR I
GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG
>90 >90 >90
>90 >90 >90
Hae III
GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA
>90 >90 >90
>90 >90 >90
Hind III
CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG
0 0 10
0 0 75
Kpn I
GGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG
0 >90 >90
0 >90 >90
Mlu I
GACGCGTC CGACGCGTCG
0 25
0 50
Nco I
CCCATGGG CATGCCATGGCATG
0 50
0 75
Nde I
CCATATGG CCCATATGGG CGCCATATGGCG GGGTTTCATATGAAACCC GGAATTCCATATGGAATTCC GGGAATTCCATATGGAATTCCC
0 0 0 0 75 75
0 0 0 0 >90 >90
Nhe I
GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG
0 10 10
0 25 50
酶
寡核苷酸序列
切割率%
2 hr
20 hr
Not I
TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA AAATATGCGGCCGCTATAAA ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
0 10 10 25 25
0 10 10 90 >90
Nsi I
TGCATGCATGCA CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
10 >90
>90 >90
Pac I
TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG
0 0 0
0 25 >90
Pme I
GTTTAAAC GGTTTAAACC GGGTTTAAACCC AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
0 0 0 75
0 25 50 >90
Pst I
GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
0 10 >90 >90 0
0 10 >90 >90 0
Pvu I
CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCGA
0 10 0
0 25 10
Sac I
CGAGCTCG
10
10
Sac II
GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA
0 50
0 >90
Sal I
GTCGAC
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