高粱生长素反应因子arf基因的全基因组分析与进化研究.pdf

, 2010, 37( 3) : 395400 Journal of Anhui AgriculturalUn ivers ity (ARF) 江海洋, 魏 巍, 刘 艳, 朱苏文, 程备久 ( , 230036) : 生长素在植物发育中的各 个阶段都起着重要作用, 而生长素反应因子 ( auxin response factors, ARF)特 异性的调节生长素反应 因的表达, 是植物细胞中重要的一类转录因子家族在拟南芥玉米水稻等模式作物中 先后克隆了一些 ARF 因, 但是高粱作为一种重要的经济作物, 这方面的研究未见报道随着高粱全 因组序列 的公布, 利用 因组序列分析 ARF 因的数目结构进化具有重要的意义利用公布的高粱全 因组数据, 利用 DNATOOLSBLASTMEGA40以及 Genom epixelizer等生物信息学软件对高粱 (So rg h um b icolor ) 生长素反应因子 ARF 因的数量物理位置系统进化树氨 酸序列及保守 序(m otif) 的保守性等进行分析结果表明, 在高粱 全 因组中共有 26 个ARF 因, 26 个ARF 因根据其进化关系分为 ABC 3类; 通过对全 因组内 ARF 因 进行物理位置和 因家族分析, 发现高粱 因组中ARF 因存在明显的 因复制现象, 因的复制对高粱 因组 中ARF 因数量扩张起到了重要的作用 : 高粱; ARF 因; 进化分析;保守 序 : S514 : A : 1672352X( 2010) Genom ew ide analysis and evolution of the auxin response factor (ARF) gene fam ily in Sorghum b ico lor JIANG Haiyang, W EIW e,i LIU Yan, ZHU Suw en, CHENG Beijiu ( School of L ife Science, Anhui Agricu lturalUn iversity, H efei 230036) Abstract: Auxin p lays an mi portant role in plant growth development. A uxin response factors(ARFs) specific ally regu late the expression of auxin response genes, and it is an mi portant transcription factor in p lant cel.l Some ARF genesw ere cloned in A rab idopsis, maize, rice and othermodels crop, but sorghum as an mi portant econom ic crop, its ARF genesw ere not reported in recent literature. W ith completing of sorghum sequence plan, analysis of number, type, evolution ofARF genes has mi portant significance. In this study, DNATOOLS, BLAST, MEGA and GenPix toolsw ere used to carry out the genomew ide analysis of sorghum (Sorg hum bicolor) ARF gene