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Advanced Bioanalytical Chemistry
Fall, 2016
朱 志
卢嘉锡 542
zhuzhi@xmu.edu.cn
第六节课 生物分子的化学标记和探针技术
2016年11月3日
;生物分子的化学标记和探针技术;Some of the common bioconjugate designs often used for life science applications include:
(A) streptavidin–enzyme conjugate
(B) an immobilized affinity ligand on a particle
(C) an oligo molecular beacon probe containing two fluorescent labels or a fluor and a quencher at each end
(D) fluorescently labeled streptavidin
(E) an affinity ligand attached to a surface
(F) a biotinylated enzyme
(G) an antibody–enzyme conjugate
(H) a fluorescently labeled antibody
(I) a biotinylated antibody
(J) a biotinylated oligo probe
(K) an antibody–drug conjugate
(L) a gadolinium chelate-modified dendrimer containing folate molecules for targeting.;;Localization of Molecules with Fluorescence Microscopy;Fluorescence Applications in Biology;Examples of Fluorescent Molecules;; Spectral observables for fluorescence sensing. From left to right: Intensity, intensity ratio, anisotropy, time-domain lifetime, and phase-modulation lifetime. ;氨基的反应(赖氨酸侧链与N末端氨基); 质子化率的计算: lg([质子受体]/[质子供体])=pH-pKLys ε-+NH3 pK=10.5 求ε- +NH3 在pH9.5及pH=11时的质子化%。;典型的NHS酯类荧光标记试剂;典型的NHS酯类荧光标记试剂;氨基的反应(赖氨酸侧链与N末端氨基);;巯基的反应(半胱氨酸侧链)
与卤乙酰胺反应;巯基的反应(半胱氨酸侧链)
与顺丁烯二酰亚胺(maleimide)反应;氨基与羧基的反应Carbodiimides (–N=C=N–) 碳酰二亚胺法;EDC (1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺);
Mechanism;EDC plus Sulfo-NHS;DCC(二环己基碳二亚胺常溶有机用于有机合成);Bioconjugate Techniques, Third Edition?3rd Edition
by?Greg T. Hermanson?(Author);Biological Labeling with Green Fluorescent Protein (GFP);双砷染料-四半胱氨酸体系;ReAsH (a phenoxaine derivative);双砷染料-四半胱氨酸重组噬菌体的构建及 应用;; The term ‘‘click chemistry’’, originally brought up by K. Barry Sharpless at The Scripps Research Institute in 2001.;Azide/Alkyne Cycloaddition;Strain-Promoted [3 + 2] Azide-Alkyne Cycloaddition;Staudinger-Bertozzi反应;Staudinger ligation reaction scheme (azide-phosphine conjugation). Phosphine-activated proteins or labeling reagents react with azide-labeled target molecules to form
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