双孢蘑菇堆肥过程中细菌群落结构分析-应用与环境生物学报.PDF

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双孢蘑菇堆肥过程中细菌群落结构分析-应用与环境生物学报

2014-10-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2014.03020 / Chin J Appl Environ Biol 2014 20 ( 5 ) : 832-839 应用与环境生物学报 , 双孢蘑菇堆肥过程中细菌群落结构分析* 1 2 1** 1 郭亚萍 张国庆 陈青君 杨 凯 1北京农学院植物科学技术学院农业应用新技术北京市重点实验室 北京 102206 2北京农学院生物科学与工程学院农业部都市农业(北方)重点实验室 北京 102206 摘 要 分别以玉米秸、牛粪和稻草、牛粪为主要原料,设计两种双孢蘑菇(Agaricus bisporus )堆肥配方并进行堆肥 发酵,研究二者堆肥过程中细菌群落多样性 . 在建堆、一次发酵结束和二次发酵结束 3个时期分别采集堆肥样品, 提取总DNA ,以大肠杆菌16S rDNA序列设计通用引物,进行PCR-DGGE扩增和序列分析. 结果获得56条特异条带 16S rDNA GenBank KF630598-KF630653 7 42 . 基因信息( 登录号为 ),分属于细菌的 个门、 个属 两种配方堆肥过程中主要类群 Proteobacteria Firmicutes Actinobacteria Bacillus 属于变形菌门( )、厚壁菌门( )和放线菌门( ),主要的优势种属包括 属、 Paenibacillus Thermomonospora Thermasporomyces Pseudomonas Cellvibrio . 属、 属、 属、 属和 属 多样性指数分析显示,在 堆肥过程中,稻草配方微生物多样性变化呈连续上升趋势,而玉米秸配方堆肥微生物多样性呈先升高、再降低的趋 势. 主成分分析(PCA )显示,玉米秸配方一次发酵结束的样品与二次发酵结束的样品聚为一类,说明玉米秸配方堆 肥比预期提前腐熟 . 本研究表明,稻草配方微生物多样性高,所需腐熟时间长;玉米秸配方微生物多样性略低,但所 需腐熟时间大大缩短 . 图4 表2 参26 PCR-DGGE 关键词 双孢蘑菇;堆肥;细菌群落结构; CLC S141.4 : Q938 Bacterial community structure analysis for mushroom (Agaricus bisporus) compost using PCR-DGGE technique* 1 2 1** 1 GUO Yaping , ZHANG Guoqing , CHEN Qingjun & YANG Kai 1College of Plant Science and Technology, Beijing Key Laboratory for Agricu

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