NCBI及GeneBank介绍(CHENGWEI)-20130327.ppt

NCBI及GenBank数据库的使用;内容提要;1.WHAT IS NCBI?;1.1.NCBI主页;1.2.跨库检索功能;1.2.跨库检索功能——检索事例;;;2.1. GenBank;2.2. PubMed;2.2.1 PubMed;2.3.GenBank VS PubMed;2.4 GenBank数据库界面;2.5 核苷酸序列数据库;（一）限定词检索（基因名、物种名、作者等） （二）特殊标志符检索（AY123456、AF123456等） （三）序列长度检索（[SLEN]） （四）范围检索 (五) 限制检索 ;2.5 核苷酸序列数据库——基本检索功能;2.5 核苷酸序列数据库——基本检索功能;（二）特殊标志符的格式（核酸序列） ;（三）序列长度检索（[SLEN]）; 1、序列接受号范围检索： AF114696:AF114714[ACCN] 序列接受号的检索限定词为[ACCN]or[ACCESSION] 2、序列长度范围检索： 3000:4000[SLEN] 3、日期范围检索： 2005/01:2007/11/13[MDAT]or[PDAT] 范围检索：中间用冒号连接(必须英文环境下！) ;（五）限制检索;;;;;;;;2.6. 核苷酸序列数据库三大子数据库;3. 检索事例;;;GenBank序列开始标志，为空行。;4.BLAST (Basic Local Alignments Tool)序列相似性比较的工具;;blastn页面;;?5.NCBI热门资源——OMIM在线人类孟德尔遗传Online Mendelian Inheritance in Man ;?5.NCBI热门资源——ESTsExpressed sequence tag;?5.NCBI热门资源——STSs 序列（测序）标签位点;?5.NCBI热门资源——SNPs Single Nucleotide Polymorphisms;?5.NCBI热门资源——UniGene ;NCBI资源十分丰富，要想熟练地在NCBI获得有用信息，还需要不断地摸索！ 谢谢！